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La Rodopsina, un pigmento de la visión que se encuentra en los ojos y que nos permite ver por la noche, posee un doble enlace que cambia de configuración y se convierte en isómero cis al isómero trans cuando la luz incide en el ojo. Como resultado un impulso nervioso viaja hacia el cerebro y permite detectar la fuente de luz. El 11-cis-retinal se sitúa unido a una de las hélices alfa en el centro de la molécula y colocado perpendicularmente. Esta colocación hace que cuando llegue luz incida en el 11-cis-retinal y este se transforme produciendo reacciones que llevan a un impulso nervioso.
La rodopsina es una proteína transmembranal que, en humanos, se encuentra en los discos de los bastones de la retina. Consta de una parte proteica, opsina, y una no proteica que es un derivado de la vitamina A que es el 11-cis-retinal. Es inestable y se altera fácilmente con la energía lumínica, se decolora y descompone por exposición a la luz y se regenera con la oscuridad.
Una mayoría microorganismos marinos no fotosintéticos captan energía de la luz solar mediante rodopsina. La proteína permite a estos organismos utilizar la energía del sol para moverse, crecer y sobrevivir ante la falta de nutrientes. La rodopsina está altamente conservada y presente en los tres grandes dominios (arqueas, bacterias y eucariotas), lo que sugiere una aparición temprana y un papel fundamental en la evolución.